Super Mario 64: Shindou Pak Taiou Version

Esta versão do Super Mario 64, lançada originalmente apenas no Japão, é uma melhoria em relação à versão internacional do jogo, pois mantém todas as correções de glitches, além de mudanças gráficas e sonoras. As principais diferenças desta versão são o suporte ao Rumble Pak, algumas pequenas correções de glitches — a mais notória sendo a remoção do backwards long jump, uma técnica muito importante para a cena de speedrunning —, e um novo easter egg na tela de título. Esta versão foi lançada posteriormente no iQue Player na China (sem suporte ao Rumble), no Wii Virtual Console e Wii U Virtual Console japoneses. Finalmente, foi localizada e lançada internacionalmente como parte de Super Mario 3D All-Stars (sob o nome de "Super Mario 64"), com pequenas melhorias visuais.